芒果密码二好性子使体基叶绿因组用偏分析
我要评论2.2 中性绘图分析
芒果叶绿体基因组GC12的芒果密码取值范围在0.33～0.56之间，GC3的叶绿因组取值范围在0.18～0.32之间，基因全部落在中线对角线上方（图1）。体基GC12与GC3的使用相关系数0.279（表2），双尾检测相关性不显著，偏好回归系数（曲线斜率）为0.3544，性分析相关性较弱。芒果密码结合图1和表2表明芒果叶绿体基因组密码子第1、叶绿因组2位和第3位碱基之间关联性不大，体基自然选择在芒果叶绿体基因组密码子偏好使用中起主要作用。使用
2.3 ENC-plot绘图分析
ENC-plot绘图以ENC比值[（预期ENC值～实际ENC值）/预期ENC值]和ENC比值频数判断偏好性影响因素，偏好揭示ENC与GC3s的性分析关系，反映碱基组对密码子偏好性的芒果密码影响程度。基因坐标点离标准曲线的叶绿因组距离近且数量较多说明偏好性主要受到突变的影响；反之说明偏好性受选择的影响较大。图2结合表3显示60%共33个基因分布在–0.05～0.05之间，体基这33个基因的实际ENC值与预期ENC值接近，与标准曲线的距离较近，分布在–0.05～0.05之外的基因有22个，这22个基因与预期ENC值较远，在标准曲线较远的位置。说明芒果基因组密码子偏好性与GC3的差异有关，突变对芒果叶绿体基因组密码子偏好性的影响较大。
2.4 PR2-plot绘图分析
PR2-plot绘图通过分析密码子第3位碱基的组成关系，揭示密码子使用偏好性的影响因素。由图3可以看出芒果基因在4个区域内分布不均匀，多数分布于平面图的左下方。T和C在密码子第3位出现的频率较高，G与C、A与T的使用频率不相等，T的使用频率高于A，C的使用频率高于G，嘧啶的使用频率高于嘌呤，说明突变不是影响芒果密码子使用偏好性的唯一因素，选择等其他因素对芒果密码子使用偏好性也产生一定的影响。
2.5 相对同义密码子使用度分析
利用codonW软件对芒果55条基因序列的RSCU值进行计算（表4）。结果显示RSCU＞1的密码子共31个，出现频率相对较高的是以A（13个）或T（16个）结尾的密码子，是芒果基因组偏爱；以G（1个）或C（1个）结尾的密码子出现的频率较低且RSCU值多小于1，说明这些是基因组非偏好的密码子。
相关链接：芒果，基因组，嘧啶，嘌呤
声明：本文所用图片、文字来源《热带作物学报》，版权归原作者所有。如涉及作品内容、版权等问题，请与本网联系
相关文章
【角色定位与核心价值】在拂晓拾荒团的末世废土世界观中，亚里沙凭借其独特的技能机制与战术适配性，成为兼具爆发输出与战场控制的双核角色。作为远程法术型单位，她不仅拥有穿透型AOE伤害能力，还能通过技能链触2025-05-11
返乡必看！春节回家应怎样做好防护，一文梳理要点 编辑：汤晓雪 来源：2025-05-11
刚刚，搭载神舟二十号载人飞船的长征二号F遥二十运载火箭在酒泉卫星发射中心点火发射。中国神20一箭穿日编辑、一审：童威楠 二审：杨月云 三审：王润2025-05-11
宿松融媒讯2月24日，我县举行福建传洋安徽智造总部基地项目签约仪式。县委副书记、县长许晓峰出席仪式并讲话。县委常委、政法委书记朱元松，县委常委、宣传部部长林丽霞，副县长赵强出席仪式。副县长肖锋主持仪式2025-05-11
作为稻妻天领奉行的大将，九条裟罗自登场以来便以独特的辅助机制成为雷系队伍的核心组件。将从技能机制、实战应用、阵容适配性等维度，解析这位兼具爆发与辅助能力的四星角色在战斗中的战略价值与使用局限。核心机制2025-05-11
中国消费者报报道记者徐文智）苹果种植业是陕西省延安市的特色优势产业。洛川苹果以果型圆润、色泽鲜艳、风味浓郁闻名遐迩，已经成为延安市一张含金量十足的地方名片。作为延安的地理标志产品，洛川苹果高质量发展的2025-05-11
最新评论